对共产国际完全脱离实际的指示，陈独秀既气愤又无可奈何。
就在此时，江西省主席朱培德以“制止过火的工农运动”为借口，武装递解共产党员全体出境，同时查封全省工会、农会、学生会。
在这一形势下，在讨论莫斯科来电的专门会议上，陈独秀对“五月指示”提出不同意见，认为莫斯科不了解中国的实际情况，“农民运动引起的过火行为（破坏了） 同地主、绅士和军官的统一战线。过火行为也妨碍了土地问题的解决。”必须“先纠正过火行为，然后采取解决土地问题的进攻性措施。”
对于改组国民党中央，陈独秀称：“国民党的领导是在党的代表大会上选举产生的，现在我们怎么能改变它呢？”
对于组建新军，陈独秀认为此时中共没有这个能力。最后，陈独秀说：“我们衷心赞同指示，但问题是我们党未必能够贯彻执行”。
罗易对陈独秀的态度表现出极大的愤慨，指责陈独秀是“国民党在共产党内的代理人”，扬言“应当把陈独秀清除出共产党领导机构”。